最新发布的《全球恐怖主义指数》（Global Terrorism Index）显示，将近5000人在一年期间死于非洲撒哈拉沙漠以南（sub-Saharan Africa）各地的恐怖主义分子之手。根据经济与和平研究所（Institute for Economics and Peace）发布的这份报告，尽管有20个国家采取了更好地保护本国公民的改进措施，但2017年该地区仍发生了1371起恐怖事件，增幅为5%。
美国国务院的一位发言人在1月16日肯尼亚内罗毕（Nairobi）的都喜D2酒店（DusitD2 Hotel）发生袭击事件后表示：“这些懦夫的袭击行径让我们充分地再次认识到，美国为什么要继续坚定地努力击溃恐怖主义”。
作为这项努力的一部分，美国同非洲撒哈拉沙漠以南的国家合作，安全地储藏、移除及销毁具有潜在危险性的材料，以防非国家行为者将其用作武器。
事实上，美国为应对世界各地的生物威胁拨款采取准备措施，作为美国《国家生物防御战略》（National Biodefense Strategy）的内容之一。
在肯尼亚保障病原体的安全
2015年的一份有关肯尼亚的医疗实验室的安全状况的报告中有一些令人担忧的数据。当时只有不到一半的实验室有库存清单。还有两个实验室报告了病原体遗失的情况。不安全的病原体对源发地周边及远处的人口均构成威胁。
2016年，肯尼亚的反恐警察部队（Anti-Terror Police Unit）逮捕了一名同伊斯兰国组织（ISIS）有联系的医疗实习生。这名嫌疑人据称试图策划一场炭疽袭击。
为应对实验室中存在的这些问题以及危险的内部人员构成的这类威胁，美国国防威胁降低局（U.S. Defense Threat Reduction Agency）出资在肯尼亚医学研究所（Kenya Medical Research Institute）修建了一个安全储藏设施。这项700万美元的工程包括生物医疗废物焚化装置以及经过修缮的实验室在内。这项资金还拨款为医院及研究人员提供全面的生物安全及生物安保培训。
消除尼日利亚的核威胁
近15年前，尼日利亚卡杜纳州（Kaduna state）的艾哈迈杜·贝罗大学（Ahmadu Bello University）的实验室曾使用一公斤武器级铀来为其用于科学试验的微型中子源反应堆提供动力。这使得该校园有可能成为博科圣地（Boko Haram）、其分支西非伊斯兰国组织（ISIS–West Africa）以及该地区可能利用这种铀来制造脏弹或将其卖给黑市上的第三方的其他非国家行为者的攻击目标。
2018年10月，美国国家核安全管理局（U.S. National Nuclear Security Administration）同一个八国团队合作移除了尼日利亚的铀，并用低浓缩铀取而代之。这种新型材料能为研究提供动力，但不会被武器化。
此外，尼日利亚科学家在新墨西哥州（New Mexico）的洛斯阿拉莫斯国家实验室（Los Alamos National Laboratory）接受了计量及鉴定核材料的培训。参加过培训的核专家拉姆·文卡塔拉曼（Ram Venkataraman）说，培训有助于保障他们的材料的安全。
销毁乍得的非法武器
位于乍得湖盆地（Lake Chad Basin）的四个国家均在非洲最易于发生冲突的国家之列。乍得几乎毫无疑问地成为该地区恐怖主义分子、叛乱分子、有时还有腐败的安全部队进行非法武器和弹药交易的一条快速通道。
自2013年以来，美国国务院同排雷咨询团（Mines Advisory Group）结成伙伴，培训乍得安全部队保障他们的武器储备的安全并进行管理。他们学习负责任地销毁多余及过时的武器和弹药，并妥善管理可供使用的武器的有关系统。美国国务院还为排雷咨询团提供资金，修建并修缮乍得的武器储备设施，以保护它们不被偷盗。
排雷咨询团迄今为止完成了以下工作：
- 帮助乍得安全部队销毁650件小型武器及轻型武器。
- 修建或修缮了99座军械库。
- 为150名安全部队人员提供了武器管理培训。
以上措施多管齐下，防止了武器被非法转移，并防止了它们流入黑市。
